科技日报北京6月13日电 (记者张梦然)美国西北大学团队开宣布一种核算东西 ,密码本可以从有限的破解基因表达数据中提取要害信息 ,辨认出多种杂乱疾病背面的杂乱多基因组合 。这项技能依据生成式人工智能(AI),疾病为未来的密码本精准医学和药物开发供给了强有力东西。研讨论文宣布在最新的破解《美国国家科学院院刊》上。
许多疾病是杂乱由多种基因一起作用决议的,而不是疾病只是一个“坏”基因形成。这种杂乱的密码本基因网络使得科学家难以精确辨认哪些基因组合会导致疾病的产生。为了应对这一应战,破解团队开发了名为TWAVE的杂乱新模型 。
该模型运用生成式AI技能 ,疾病模仿健康和患病状况下的密码本基因表达状况 ,然后将基因活动的破解改变与表型改变相对应 。它不只辨认参加疾病开展的杂乱基因群,还运用优化算法精确定位最或许引发细胞状况改变的要害基因改变 。
现在,广泛运用的全基因组相关研讨(GWAS)首要寻觅与特定性状相关的单个基因 ,但它们缺少计算才能来检测多个基因之间的协同效应。TWAVE不依赖于基因序列自身,而是聚集于基因表达水平。团队运用临床试验数据练习模型,使其能辨认代表健康或患病状况的表达谱。关于部分基因,他们还结合试验数据 ,调查这些基因敞开或封闭时对整个网络的影响,然后更精确地找到与疾病相相关的基因网络。
这种办法具有多重优势。它绕过了基因序列带来的隐私问题,并且,基因表达天然包含了环境要素的影响,模型能直接反映外部要素的作用。
为了验证TWAVE的实践使用作用 ,团队在几种杂乱疾病中进行了测验。结果表明,该办法不只能成功辨认已知致病基因,还能发现一些被现有办法疏忽的新基因 。更重要的是 ,它提醒出同一种疾病或许在不同人群中由不同的基因组合引起